В 1908 году Алихан Букейханов был арестован. О следующих нескольких годах его жизни историки спорят по сей день. Одни говорят, что сразу после ареста он оказался в Семипалатинской тюрьме. Другие исследования и архивные фотографии гласят, что в 1908 году он находился в Павлодаре. Третьи и вовсе утверждают, что с 1908 года по 1917 год Алихан Букейханов пребывал в ссылке в Самарской губернии. Как бы то ни было, но этот период жизни А. Букейханова был тесно связан с публицистикой. В эти годы он «видел будущее киргизской степи в сознательном претворении западной культуры» и активно сопротивлялся русской колонизации казахской степи, так как знал, насколько тяжелыми могут стать ее последствия для коренного населения степи. Сотни его научных и публицистических статей исследовали народное хозяйство степи, ее экономику, историю, этнографию, литературу, отрасли земледелия и животноводства.