Бюджетная прозрачность Назарбаев Университета давно вызывает вопросы экспертов. Известный политолог Марат Шибутов, давно критикующий Назарбаев Университет, на фоне новостей об отставке президенту ВУЗа Шигео Катсу заметил, что нужно проверять непрозрачный бюджет университета. Дословно: Зарплаты в миллионы «Смотрю как завкафедрой в НУ Алима Бисенова протестует против проверок и прозрачности Назарбаев Университета – называет это «антизападным настроем».